古代線粒體基因組揭示了東亞狼的母系遺傳史
摘要:(機翻)
灰狼 (Canis lupus) 是狗 (Canis lupus familiaris) 唯一的野生祖先,在理解極具爭議的狗起源問題方面發揮著至關重要的作用。近來,對來自歐亞大陸不同地區的灰狼的古代 DNA 研究取得了重大突破,為狗的起源提供了重要線索。作為狗的潛在起源地區之一,東亞已經對古代狗進行了一些研究;然而,與灰狼有關的報道仍然有限。在這項研究中,我們對中國北方古代灰狼的 7 個新線粒體基因組進行了測序,并將它們與已發表數據的 497 個古代和現代犬科動物線粒體基因組進行了整合。研究結果顯示:(1)東亞灰狼自古至今一直保持著較高的遺傳多樣性;(2) 來自中國北方的多個單倍群 A 灰狼支持歐亞大陸東北部是狗起源的核心地區的假設;(3) 本研究在東亞發現了深灰狼譜系;(4)集中在金蟬口遺址的不同有絲分裂基因組表明,青藏高原東北緣的混合可能頻繁發生。這些發現增強了我們對東亞灰狼母系遺傳史的理解。
簡單說一下具體有哪些要點以及夾帶自己的看法,具體還請自行去看原文。
1. 黑龍江哈爾濱的一只年份為大概70000-130000的古東亞狼母系是整個低海拔狼的根基母系(也就是除了藏狼以外的整個Gray Wolves (Canis lupus)的根基,很深的早期譜系,在和藏狼分開后就分裂出來,可能代表了早期古東亞狼的深厚當地祖先)。
2. 黑龍江流域又測出了跟家犬母系A很接近的古代狼,算上之前東北的另一批,古代黑龍江流域的主流母系可能就是A。順帶一提和家犬母系A接近的還有只被標記成西伯利亞地區的俄羅斯狼(Pospelovo_1, Primorsky Krai),而實際上這個Primorsky Krai是外東北那塊的俄羅斯濱海邊疆區,平均維度可能就略高于吉林,Pospelovo搜了一下具體位置似乎在海參崴的某個島上,要是這樣的話那比吉林長春還南一點,所以其實應該算是個根正苗紅的東亞狼。
3. 河北康保新隆遺址也有一只A系的古代狼,按出土遺址的文化推測是8000年,但基因推測是25000年左右的古代狼。結合東北的數據,可以推測晚更新世到全新世初東亞北部的東部——華北到東北一帶的古代狼母系主流可能就是A,家犬最重要的母系A的起源地也可能在這一片地方。
4. 黃河上游的青海金蟬口遺址出土了一只4000-6000左右的母系E的犬科,應該不能確定是狼或是狗又或者是混血狼。不過能肯定的是現代東亞犬里的E系有了依據,可能就來源于這里或者臨近地區的狼狗混血。在研究人員所采集的數據中,支系E在現代中國沒有分布,僅有少量分布在朝鮮半島和東南亞,但從邏輯上推測中國大概率存在E,可能是取樣方面運氣不太好。但土狗愛好者有測過embark的南方狗測出是母系E,這樣基本能實錘這也是一個根正苗紅的古代東亞母系了。
5. 然后還是那個問題,現有的東西伯利亞古今犬科數據都不怎么支持東西伯利亞起源,包括這次的A系比例,東西伯利亞也遠比不上黑龍江流域,再者亞納河流域以南到外興安嶺以北都沒什么數據,基本全靠黑龍江流域甚至更低緯度的數據支撐著這個“東北歐亞”,所以不是很清楚為什么一定得是東北歐亞起源而不能是東亞北部起源。2022年的古代狼都只用了東歐亞這個稱呼,并且不支持他們取樣附近的亞納河流域起源,2024年日本狼研究支持的是東亞起源,這黑龍江流域以北的地方我實在想不明白是怎么蹭上車的,就算猜這塊地方起源也得多少有點數據吧我覺得?
母系A的樹
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