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一、細胞結構

真菌：真菌是真核生物，細胞具有典型的真核細胞結構。它有細胞核，核膜將DNA包裹起來，形成染色體結構。例如酵母菌，其細胞核清晰可見，DNA在細胞核內與組蛋白等結合。

真菌的細胞壁成分主要是幾丁質（除了少數低等真菌細胞壁含有纖維素外），這與植物細胞壁的纖維素成分不同。幾丁質能夠為真菌細胞提供強度和保護，就像一層堅固的外殼包裹著細胞。

真菌細胞內有多種細胞器，如線粒體用于能量產生、內質網用于蛋白質和脂質合成等。以霉菌為例，在其細胞的超微結構觀察中可以發現線粒體、內質網等細胞器的存在。

原生動物：原生動物同樣是真核生物，有真正的細胞核。不過，原生動物的細胞結構更加多樣化，因為它們需要適應不同的生存方式。原生動物沒有細胞壁，這使得它們的細胞形狀更加靈活多變。例如變形蟲，它可以通過改變自身細胞膜和細胞質的形狀，伸出偽足來進行運動和攝食，這種靈活性是沒有細胞壁的結果。

原生動物具有用于運動、攝食等功能的特殊細胞器。像草履蟲，其細胞表面有大量的纖毛，這些纖毛是一種細胞器，通過有規律地擺動來推動草履蟲在水中游動；同時它還有口溝用于攝取食物、伸縮泡用于調節滲透壓等特殊結構。

二、運動方式

真菌：大部分真菌是不能運動的，它們通過菌絲的生長來擴展自身的分布范圍。菌絲是真菌的營養體，呈絲狀，可以在基質（如土壤、木材等）中延伸生長。例如，在發霉的面包上看到的霉菌，其菌絲會在面包內部和表面蔓延生長，以獲取更多的營養物質。不過，也有少數真菌的孢子（真菌的繁殖體）可以借助外力（如風力、水流等）進行傳播，這在一定程度上也算是一種被動的“運動”。

原生動物：原生動物具有多種主動運動方式。如前所述，草履蟲通過纖毛的擺動在水中快速游動，纖毛的運動就像船槳劃水一樣有規律。變形蟲則是利用偽足進行運動，偽足的形成是細胞質的流動和細胞膜的伸展，它通過改變偽足的位置和形狀來推動身體前進，這種運動方式比較緩慢但靈活。還有一些原生動物通過鞭毛的擺動來運動，鞭毛的結構和運動方式與纖毛有相似之處，但通常比纖毛更長、更少。

三、繁殖方式

真菌：真菌的繁殖方式多樣。有無性繁殖和有性繁殖。無性繁殖方式包括出芽生殖（如酵母菌），酵母菌在環境適宜時，母細胞上會產生一個小芽體，芽體逐漸長大，最后與母細胞分離，成為一個新的個體；還有孢子生殖，許多真菌通過產生大量的孢子來繁殖，孢子可以通過風、水等媒介傳播到新的環境中，在適宜的條件下萌發成新的菌絲體。有性繁殖涉及到兩個不同性別的配子或菌絲的結合，經過復雜的過程形成有性孢子，如擔子菌的擔子上產生擔孢子，這種繁殖方式可以增加遺傳多樣性。

原生動物：原生動物的繁殖方式也有多種。無性繁殖方式包括二分裂（如變形蟲），一個細胞直接分裂成兩個大小基本相等的子細胞；還有復分裂，即細胞核先進行多次分裂，然后細胞質再圍繞著多個細胞核進行分裂，形成多個子細胞。有性繁殖方式如接合生殖，以草履蟲為例，兩個草履蟲通過口溝部位相互連接，進行細胞質和部分遺傳物質的交換，然后分開，各自進行細胞分裂，產生子代個體，這種方式能夠增加遺傳變異。

總之，真菌有細胞壁，而原生動物沒有。