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小沙冬青遺傳多樣性的RAPD分析
小沙冬青(Ammopiptanthus nanus(M.Pop.)Chengf.),也叫矮沙冬青、新疆沙冬青、矮黃花木,豆科(Leguminosae)沙冬青屬(Ammopiptanthus)植物,分布區(qū)極其狹窄,在中國僅分布于新疆克孜勒蘇克爾柯孜自治州烏恰縣境內(nèi),是新疆特有的常綠灌木之一,被列為國家二級瀕危保護(hù)植物,也是古老的第三紀(jì)殘遺種,具有重要的研究價值。本文以來源于烏恰縣境內(nèi)自然分布的6個小沙冬青居群的120份樣品為研究對象,研究了其RAPD-PCR反應(yīng)條件,并應(yīng)用RAPD分子標(biāo)記對其遺傳多樣性水平和種群遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析,結(jié)果表明:RAPD-PCR優(yōu)化的最終體系為:20μl反應(yīng)體系中:Mg2+2.5mmol/L,dNTPs0.15mmol/L,primer0.3μmol/L,DNA100ng/L,TaqDNA聚合酶2U。PCR擴(kuò)增程序為:95℃變性2min;94℃變性40s,36℃退火1min,72℃延伸2min,40個循環(huán);72℃延伸10min。4℃保存。篩選得到的8條RAPD隨機(jī)引物共檢測出48條擴(kuò)增DNA片段,其中多態(tài)性條帶46條,多態(tài)性比率(PPB)為95.83%,平均每條引物檢測到的位點數(shù)為8個,多態(tài)性位點數(shù)7.6個。Nei's基因多樣性(H)值為0.3520,Shannon's信息多樣性指數(shù)(I)值為0.5167,居群間遺傳分化系數(shù)Gst為0.3296,表明小沙冬青的遺傳變異主要存在居群內(nèi)(67.04%)。基因流Nm為1.0170,6個居群的小沙冬青雖然在居群內(nèi)有豐富的遺傳變異,但居群之間已經(jīng)產(chǎn)生了遺傳變異和分化。根據(jù)RAPD擴(kuò)增結(jié)果建立小沙冬青的UPGMA聚類圖,所有居群在0.254處劃分為兩大類群,一支是吾合沙魯居群和2個肖爾布拉克居群,另一支是康蘇居群、巴音庫魯鄉(xiāng)的阿合其居群和托帕爾居群。小沙冬青6個自然居群的遺傳距離的分子聚類結(jié)果與其地理分布位置密切相關(guān)。
本文為焦培培, 張玲, 雍曉鵬,等. 小沙冬青遺傳多樣性的RAPD分析[C]// 生態(tài)文明建設(shè)中的植物學(xué):現(xiàn)在與未來——中國植物學(xué)會第十五屆會員代表大會暨八十周年學(xué)術(shù)年會論文集——第4分會場:資源植物學(xué). 0.的摘要部分。
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