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Nature子刊|先進(jìn)院合成所/哈工大建立雜合體的綠色生物制造技術(shù)

媒體:遇見生物合成  作者:內(nèi)詳
專業(yè)號(hào):孫瑩 2023/10/17 16:03:36

2023年10月16日,中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院合成所高翔課題組與哈爾濱工業(yè)大學(xué)(深圳)路璐課題組合作的成果以article形式在Nature Sustainability上發(fā)表。題目為“Solar-driven waste-to-chemical conversion by wastewater-derived semiconductor biohybrids”。 不同于石油基和糖基生物發(fā)酵的化學(xué)品生產(chǎn)路線,該工作利用實(shí)際工業(yè)廢水規(guī)模化合成半導(dǎo)體材料-細(xì)菌雜合體,實(shí)現(xiàn)光能驅(qū)動(dòng)污染物到化學(xué)品的高值轉(zhuǎn)化,創(chuàng)建一條污染物基光驅(qū)生物制造路線,為化學(xué)品的可持續(xù)生產(chǎn)提供重要的新方向。

可持續(xù)發(fā)展路線是人類社會(huì)生存和發(fā)展的根本,但化工制造主要依賴于化石燃料,并持續(xù)釋放CO2,環(huán)境不友好且不可持續(xù);生物制造為化學(xué)品合成提供了一條可持續(xù)發(fā)展路線,傳統(tǒng)糖基生物發(fā)酵生成還原力(NADH等)的過程會(huì)同時(shí)釋放CO2,從而降低了化學(xué)產(chǎn)品的碳轉(zhuǎn)化率;光能是充足的清潔能源,半導(dǎo)體材料-生物雜合體是將高效吸收光能的半導(dǎo)體與細(xì)胞工廠結(jié)合,可以直接利用光能為細(xì)胞工廠提供還原力,因此,光驅(qū)動(dòng)雜合體生產(chǎn)化學(xué)品具有更高的理論碳轉(zhuǎn)化率,在綠色生物制造領(lǐng)域體現(xiàn)出獨(dú)特優(yōu)勢(shì)和較大的潛力,但目前缺乏低成本、環(huán)境友好型的方法規(guī)模化合成雜合體。

減污降碳、協(xié)同增效是實(shí)施可持續(xù)發(fā)展的基本準(zhǔn)則,本項(xiàng)目通過合成生物學(xué)方法改造微生物細(xì)胞工廠,以廢水中的金屬離子、硫酸鹽和有機(jī)物污染物作為原料,通過生物法實(shí)現(xiàn)半導(dǎo)體材料-生物雜合體規(guī)模化生產(chǎn),并在原位利用光能驅(qū)動(dòng)有機(jī)污染物轉(zhuǎn)化為化學(xué)品,降低化學(xué)品生產(chǎn)成本和CO2排放,實(shí)現(xiàn)污染物高效資源化利用。本項(xiàng)目成果的成功應(yīng)用,不僅為廢水處理提供了一種新途徑,還揭示了其在清潔能源生產(chǎn)和可持續(xù)制造中的廣泛應(yīng)用潛力。

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文章鏈接:https://doi.org/10.1038/s41893-023-01233-2

 

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1.基于廢水的半導(dǎo)體材料-細(xì)菌雜合體光驅(qū)生物制造。

 

“變廢為寶”的理念與可持續(xù)性發(fā)展高度契合。近年來,通過合成生物學(xué)方法改造微生物細(xì)胞工廠,可直接利用廢棄塑料、餐廚垃圾和工業(yè)廢氣(如CO2)等作為原料,已經(jīng)展示出綠色可持續(xù)生產(chǎn)化學(xué)品的巨大潛力。來自深圳先進(jìn)院的合成生物學(xué)團(tuán)隊(duì)和哈工大(深圳)環(huán)境科學(xué)與工程團(tuán)隊(duì)共同調(diào)研發(fā)現(xiàn),金屬離子、硫酸鹽和有機(jī)物等污染物在廢水中普遍存在且含量豐富,可直接或間接為半導(dǎo)體材料-細(xì)菌雜合體的生產(chǎn)提供原料,降低規(guī)模化生產(chǎn)雜合體的成本;而且,該雜合體在廢水中能夠直接利用光能驅(qū)動(dòng)有機(jī)污染物轉(zhuǎn)化為化學(xué)品,實(shí)現(xiàn)污染物的資源化利用。

但廢水中的污染物組成成分復(fù)雜且多數(shù)具有生物毒性,有機(jī)物種類繁多,通常含有較高的鹽濃度,因此利用微生物細(xì)胞工廠實(shí)現(xiàn)污染物資源化利用極具挑戰(zhàn)。研究團(tuán)隊(duì)選擇一種海洋微生物—需鈉弧菌,其對(duì)有毒環(huán)境耐受性強(qiáng),高鹽生長(zhǎng),能使用超過200多種的有機(jī)物,包括糖、醇、氨基酸、有機(jī)酸等作為營(yíng)養(yǎng)物質(zhì);另外,需鈉弧菌是目前生長(zhǎng)最快的工業(yè)微生物,遺傳操作工具成熟,但其生長(zhǎng)速率比大腸桿菌快一倍,具有更高的底物利用速率,且含有類似電活性微生物的膜電子傳遞通道,有利于半導(dǎo)體材料光生電子進(jìn)入細(xì)胞;因此,需鈉弧菌是利用廢水生產(chǎn)雜合體的理想底盤細(xì)胞。

那么,需鈉弧菌是如何協(xié)同利用多種污染物合成半導(dǎo)體材料-細(xì)菌雜合體系并原位利用光能驅(qū)動(dòng)化學(xué)品的可持續(xù)生產(chǎn)?

半導(dǎo)體材料-細(xì)菌雜合體的設(shè)計(jì)與合成

首先,金屬硫化物的半導(dǎo)體材料需要硫化氫(H2S)作為直接前體來合成。傳統(tǒng)生物法合成金屬硫化物需要添加半胱氨酸來生產(chǎn)H2S,而廢水中含有的硫酸鹽是無機(jī)硫源,不能直接被需鈉弧菌利用并轉(zhuǎn)化為H2S。研究團(tuán)隊(duì)在需鈉弧菌中引入一條好氧H2S合成途徑,構(gòu)建直接利用硫酸鹽高產(chǎn)H2S的工程菌,該工程菌生產(chǎn)的H2S可以直接與金屬離子結(jié)合生成金屬硫化物的半導(dǎo)體納米顆粒,且同步實(shí)現(xiàn)溶液中金屬離子的高效去除(去除率高達(dá)99%)。

第二,不同來源的廢水中金屬離子濃度差異大,上述工程菌是否適用于不同濃度的金屬離子來生產(chǎn)半導(dǎo)體納米顆粒?研究團(tuán)隊(duì)首先考察工程菌利用不同濃度的鎘離子合成CdS的效率,結(jié)果顯示工程菌完全可利用不同濃度的Cd2+生產(chǎn)CdS納米顆粒。通過掃描電鏡(SEM)、透射電鏡(TEM)和光電化學(xué)分析發(fā)現(xiàn),該工程菌成功地合成CdS-細(xì)菌雜合體,該半導(dǎo)體納米顆粒吸收光能可以產(chǎn)生電子,具有較好的光電轉(zhuǎn)化效率。

第三,廢水中含有多種不同的有機(jī)物,工程菌是否可以利用不同的有機(jī)物實(shí)現(xiàn)雜合體的合成?研究團(tuán)隊(duì)以廢水中常見的有機(jī)污染物(糖、醇和酸等)作為原料,成功實(shí)現(xiàn)半導(dǎo)體材料-細(xì)菌雜合體的合成,并同步高效去除污染物中的金屬離子。

最后,研究團(tuán)隊(duì)利用實(shí)際工業(yè)廢水:甘油廢水、糖蜜廢水和淀粉廢水,成功地合成雜合體,該雜合體具有良好的光電轉(zhuǎn)化效率。該方法同樣適用于其他金屬離子,成功構(gòu)建了硫化鉛-細(xì)菌雜合體、硫化汞-細(xì)菌雜合體,普適性強(qiáng)。

半導(dǎo)體材料-細(xì)菌雜合體的光驅(qū)生物制造

 

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2.半導(dǎo)體材料-細(xì)菌雜合體的光驅(qū)生物制造。

 

雜合體可以直接利用光能驅(qū)動(dòng)微生物胞內(nèi)還原力高效再生,與非雜合體(單純微生物體系)相比,合成化學(xué)品的產(chǎn)量和碳轉(zhuǎn)化率更高。研究團(tuán)隊(duì)考察利用污染物生產(chǎn)的雜合體是否具有同樣的優(yōu)勢(shì)。2,3-丁二醇(BDO)是一種重要的大宗化學(xué)品,廣泛用于化妝品、農(nóng)業(yè)、醫(yī)藥治療等多個(gè)領(lǐng)域,且BDO生物合成過程需要消耗大量還原力NADH,雜合體通過半導(dǎo)體材料吸收光能產(chǎn)生的電子可能潛在提高NADH再生速率,驅(qū)動(dòng)BDO高效合成;研究團(tuán)隊(duì)在雜合體中構(gòu)建BDO合成途徑并檢測(cè)其合成效率,結(jié)果顯示:光照條件下雜合體系合成BDO產(chǎn)量要明顯高于非雜合體,其產(chǎn)量提高2倍、碳轉(zhuǎn)化率提高26%,且雜合體的優(yōu)勢(shì)完全依賴光能(黑暗條件,雜合體合成BDO的產(chǎn)量和碳轉(zhuǎn)化率與非雜合體相近)。證實(shí)了利用廢水生產(chǎn)的雜合體,可以直接利用光能驅(qū)動(dòng)化學(xué)品的高效合成。

研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步解析雜合體利用光能驅(qū)動(dòng)化學(xué)品高效合成的機(jī)制,通過胞內(nèi)代謝物定量分析發(fā)現(xiàn),雜合體在光照條件與黑暗條件相比,微生物胞內(nèi)的NADH濃度更高,該結(jié)果表明雜合體中,半導(dǎo)體材料通過吸收光能產(chǎn)生的電子,促進(jìn)NAD+還原生成NADH,為BDO的生物合成途徑提供充足的能量,并減少通過糖氧化過程提供能量,最終提高BDO的產(chǎn)量和碳轉(zhuǎn)化率。

基于實(shí)際工業(yè)廢水的規(guī)模化生產(chǎn)雜合體和光能驅(qū)動(dòng)化學(xué)品合成

 

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4.雜合體規(guī)模化生產(chǎn)和光能驅(qū)動(dòng)化學(xué)品合成。

 

研究團(tuán)隊(duì)以實(shí)際工業(yè)廢水為原料,在5-L光反應(yīng)器中,利用工程菌實(shí)現(xiàn)協(xié)同利用多種污染物合成雜合體,該雜合體在廢水中原位利用光能,將有機(jī)污染物轉(zhuǎn)化為BDO,產(chǎn)量可達(dá)到13 g/L,表明本研究建立的雜合體合成和原位利用光能生產(chǎn)化學(xué)品體系具有放大生產(chǎn)的潛力。

 

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5.生命周期分析顯示雜合體的光驅(qū)化學(xué)品生產(chǎn)路線更具優(yōu)勢(shì)。

 

通過生命周期分析(LCA),與傳統(tǒng)的石油基和糖基生物發(fā)酵化學(xué)品相比,本項(xiàng)目建立的污染物基雜合體光驅(qū)生物制造路線,溫室氣體排放(0.50 ± 0.02 kg CO2-eq kg-1 BDO)和產(chǎn)物生產(chǎn)成本(0.39 ± 0.04 $ kg-1 BDO)更低,利用光能實(shí)現(xiàn)污染物高效資源化利用。

該工作開發(fā)了一種低成本、環(huán)境友好、可持續(xù)的光能驅(qū)動(dòng)化學(xué)品合成方法,實(shí)現(xiàn)了協(xié)同利用多種廢水污染物可持續(xù)生產(chǎn)半導(dǎo)體材料-生物雜合體系并原位應(yīng)用于光能驅(qū)動(dòng)化學(xué)品合成,證實(shí)了該體系具有規(guī)模化放大生產(chǎn)的潛力,為實(shí)現(xiàn)清潔生產(chǎn)、降低碳排放、提高資源利用率以及推動(dòng)循環(huán)經(jīng)濟(jì)提供了新的可能性。未來將進(jìn)一步探索其在大規(guī)模生物制造中的應(yīng)用。

中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院合成生物學(xué)研究所高翔副研究員為最后通訊作者,哈爾濱工業(yè)大學(xué)(深圳)路璐為共同通訊作者,哈爾濱工業(yè)大學(xué)(深圳)和深圳先進(jìn)技術(shù)研究院聯(lián)合培養(yǎng)博士后皮姍姍、深圳先進(jìn)技術(shù)研究院博士后楊文君和上海大學(xué)馮煒教授為本文第一作者,楊睿潔、晁偉翔、程文波、崔蕾和李志達(dá)參與該項(xiàng)工作,新加坡國(guó)立大學(xué)林藝良教授為該研究做出重要貢獻(xiàn)。中國(guó)科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心楊琛研究員、深圳先進(jìn)技術(shù)研究院鐘超研究員、哈爾濱工業(yè)大學(xué)任南琪院士為該研究提供重要指導(dǎo)和建設(shè)性的意見。該工作獲得了國(guó)家自然科學(xué)基金、深圳市科創(chuàng)委、合成生物學(xué)重點(diǎn)研發(fā)專項(xiàng)和深圳合成生物學(xué)創(chuàng)新研究院等項(xiàng)目的支持。

【點(diǎn)評(píng)】趙國(guó)屏(中國(guó)科學(xué)院院士,中國(guó)科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心)

半導(dǎo)體材料-生物雜合體的核心是將高效吸收光能的半導(dǎo)體納米材料與微生物細(xì)胞結(jié)合,通過將半導(dǎo)體材料吸收光能產(chǎn)生電子并轉(zhuǎn)化為生物能,為細(xì)胞工廠提供了充足的能量,使傳統(tǒng)不能利用光能的工業(yè)發(fā)酵微生物(如大腸桿菌、酵母和需鈉弧菌等)能夠高效地利用光能來驅(qū)動(dòng)生物合成反應(yīng),將有機(jī)物(如糖等)轉(zhuǎn)化為目標(biāo)化學(xué)品。這個(gè)概念的獨(dú)特之處在于,它將光能與生物制造有機(jī)地結(jié)合,從而驅(qū)動(dòng)高效的化學(xué)品合成。

但實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo),尚缺乏低成本、環(huán)境友好型的方法規(guī)模化合成雜合體,為了克服這一難題,高翔等研究團(tuán)隊(duì)采用了合成生物學(xué)與環(huán)境工程的跨學(xué)科方法,構(gòu)建需鈉弧菌細(xì)胞工廠,將廢水中的多種污染物作為原料,實(shí)現(xiàn)了規(guī)模化生產(chǎn)雜合體和光能驅(qū)動(dòng)污染物的高值轉(zhuǎn)化。這不僅有助于減少?gòu)U水中的污染物,還為污染物資源化利用提供了新技術(shù),為化學(xué)品的規(guī)模化、可持續(xù)生物制造提供了新思路。這項(xiàng)研究代表了綠色生物制造領(lǐng)域的重要進(jìn)展,將太陽(yáng)能和生物制造相結(jié)合,創(chuàng)造了一種可持續(xù)的化學(xué)品生產(chǎn)方法。有望為實(shí)現(xiàn)清潔生產(chǎn)、減少碳排放和提高廢物資源利用率帶來新的可能性。未來,我們可以期待看到這一方法在更廣泛的應(yīng)用中發(fā)揮重要的乃至變革性的賦能作用。

實(shí)驗(yàn)室簡(jiǎn)介

高翔課題組主要研究方向?yàn)榘雽?dǎo)體合成生物學(xué),將高效吸收光能的半導(dǎo)體材料與高選擇性催化的活細(xì)胞集成,合成一種新的人工體系(“人工光細(xì)胞”),利用微生物的優(yōu)異胞內(nèi)催化能力將半導(dǎo)體吸收的光能轉(zhuǎn)化為化學(xué)能,致力于突破天然光合固碳的理論極限,合成人工光能自養(yǎng)細(xì)胞工廠,發(fā)展化學(xué)品的可持續(xù)生物制造技術(shù)。研究成果以第一和通訊(含共同)作者身份,發(fā)表在Nature Sustainability、Nature Chemistry、Science Advances、Energy & Environmental Science、ACS Energy Letters等期刊上;課題組現(xiàn)招聘有合成生物學(xué)、微生物學(xué)、電化學(xué)、光電催化、半導(dǎo)體材料等相關(guān)背景博士后2名,研究助理1名,同時(shí)招收聯(lián)合培養(yǎng)學(xué)生2名,歡迎有志之士前來咨詢并加入我們的研究團(tuán)隊(duì)(聯(lián)系郵箱:gaoxiang@siat.ac.cn)。

文章來源自公眾號(hào):遇見生物合成

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